Прощание с Борисом Васильевичем Ананьичем, где присутствовали близкие, друзья, коллеги, ученики, ученые Москвы и Петербурга, прошло 25 июля в Санкт-Петербургском Институте истории РАН, в котором он проработал более 50 лет. Погребение состоялось на Смоленском кладбище.