С 1960 г. по 1986 г. было издано 16 тематических выпусков «Трудов ЛОИИ».
С 2015 г. возобновлено периодическое издание «Труды Санкт-Петербургского института РАН».
Вып. 7(23). Российское государство в XVI — начале XVIII века : сборник статей к 70-летию Андрея Павловича Павлова / сост.: А. И. Раздорский ; науч. ред.: Д.В. Лисейцев, П.В.Седов. — СПб.; М.: Старая Басманная, 2022. — 507, [1] с. : ил., карты, [5] л. портр. (Труды Санкт-Петербургского института истории РАН). ISBN 978-5-907169-68-5
Вып. 6(22). Связь времен и творчество историка: Памятный сборник к 90-летию Виктора Моисеевича Панеяха. — СПб.: Нестор-История, 2021. — 484 с. — (Труды Санкт-Петербургского института истории РАН). ISBN 978-5-4469-1895-9
Вып. 5(21). Петр Великий, российская власть и общество в эпоху перемен: Сборник статей к 70-летию со дня рождения Юрия Николаевича Беспятых. — СПб.: Историческая иллюстрация, 2019. — 400 с. (Труды Санкт-Петербургского института истории РАН). ISBN 978-5-4469-1479-1
Вып. 4(20). Новгородская земля, Санкт-Петербург и Швеция в XVII—XVIII веках: Сборник статей к 100-летию со дня рождения Игоря Павловича Шаскольского. СПб.: Нестор-История, 2018. (Труды СПбИИ РАН). Тир. 300.
Вып. 3(19). Европейская Реформация и ее возможные аналоги в России. — СПб.: Нестор-История, 2017. — 492 с. — (Труды Санкт-Петербургского института истории РАН; вып. 3 (19)). Тир. 500. ISBN 978-5-4469-1281-0
Вып. 2(18). Санкт-Петербургский институт истории РАН в документах XIX—XX веков. — СПб.: Нестор-История, 2016. — 496 с. — (Труды Санкт-Петербургского института истории РАН; вып. 2 (18)). Тир. 500 экз. ISBN 978-5-4469-09974
Вып. 1(17). Монастыри и архиерейские дворы в документах XVI-XVIII веков. СПб.: Нестор-История, 2015. 720 с. ISBN 978-5-4469-0760-1. Тир. 500 экз. Аннотации
Вып. 16. Общественная мысль в России XIX в. Л.: «Наука». 1986. 244 с.
Вып. 15. Критика новейшей буржуазной историографии. Л.: «Наука». 1976.
Вып. 14. Проблемы государственного строительства в первые годы советской власти. Л.: «Наука». 1973. 361 с.
Вып. 11. Исторические связи Скандинавии и России. IX—XX вв. Л.: «Наука». 1970. 402 с.
Вып. 10. Критика новейшей буржуазной историографии. Л.: «Наука». 1967. 382 с.
Вып. 8. Внутренняя политика царизма (Середина XVI—начало XX в.). Л.: «Наука». 1967. 400 с.
Вып. 6. Рабочие Ленинграда в борьбе за победу социализма. М.; Л. Изд-во АН CCCP. 1963. 359c.
Вып. 5. Вопросы историографии и источниковедения истории СССР. М.; Л. Изд-во АН СССР. 1963. 655 с.
Вып. 4. Монополии и иностранный капитал в России. М.; Л. Изд-во АН СССР. 1962. 434 с.
Вып. 3. Критика новейшей буржуазной историографии. М.; Л. Изд-во АН СССР. 1961. 444 с.
Вып. 1. Из истории империализма в России. М.; Л. 1959. Изд-во АН СССР. 457 с.
